MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes J0161 chromosome

Total Repeats: 68579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017545	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017545	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017545	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017545	G	7	7	306	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017545	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	386045635
6	NC_017545	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
7	NC_017545	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045635
8	NC_017545	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
9	NC_017545	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045635
10	NC_017545	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
11	NC_017545	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045635
12	NC_017545	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386045635
13	NC_017545	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045635
14	NC_017545	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
15	NC_017545	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045635
16	NC_017545	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
17	NC_017545	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	386045635
18	NC_017545	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
19	NC_017545	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
20	NC_017545	AC	3	6	1015	1020	50 %	0 %	0 %	50 %	386045635
21	NC_017545	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
22	NC_017545	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
23	NC_017545	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	386045635
24	NC_017545	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045635
25	NC_017545	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
26	NC_017545	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
27	NC_017545	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045635
28	NC_017545	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045635
29	NC_017545	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045635
30	NC_017545	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045635
31	NC_017545	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
32	NC_017545	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	386045635
33	NC_017545	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045635
34	NC_017545	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
35	NC_017545	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	386045635
36	NC_017545	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	386045635
37	NC_017545	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045635
38	NC_017545	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045635
39	NC_017545	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045635
40	NC_017545	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
41	NC_017545	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045635
42	NC_017545	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	386045635
43	NC_017545	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017545	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017545	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017545	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017545	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017545	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045636
49	NC_017545	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
50	NC_017545	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
51	NC_017545	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045636
52	NC_017545	TCG	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045636
53	NC_017545	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045636
54	NC_017545	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	386045636
55	NC_017545	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045636
56	NC_017545	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	386045636
57	NC_017545	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	386045636
58	NC_017545	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
59	NC_017545	ACA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045636
60	NC_017545	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	386045636
61	NC_017545	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045636
62	NC_017545	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	386045636
63	NC_017545	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045636
64	NC_017545	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045636
65	NC_017545	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045636
66	NC_017545	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045636
67	NC_017545	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045636
68	NC_017545	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
69	NC_017545	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045636
70	NC_017545	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017545	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017545	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045637
73	NC_017545	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045637
74	NC_017545	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
75	NC_017545	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045637
76	NC_017545	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045637
77	NC_017545	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045637
78	NC_017545	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
79	NC_017545	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
80	NC_017545	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045637
81	NC_017545	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
82	NC_017545	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
83	NC_017545	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045637
84	NC_017545	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045637
85	NC_017545	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045637
86	NC_017545	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045637
87	NC_017545	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
88	NC_017545	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	386045637
89	NC_017545	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045637
90	NC_017545	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045637
91	NC_017545	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386045637
92	NC_017545	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045637
93	NC_017545	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045637
94	NC_017545	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386045637
95	NC_017545	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
96	NC_017545	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045637
97	NC_017545	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	386045637
98	NC_017545	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045637
99	NC_017545	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	386045637
100	NC_017545	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045637
101	NC_017545	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	386045637
102	NC_017545	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045637
103	NC_017545	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017545	T	7	7	4504	4510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017545	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017545	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
107	NC_017545	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017545	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017545	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045638
110	NC_017545	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	386045638
111	NC_017545	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	386045638
112	NC_017545	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045638
113	NC_017545	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	386045639
114	NC_017545	TGCT	2	8	5002	5009	0 %	50 %	25 %	25 %	386045639
115	NC_017545	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045639
116	NC_017545	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045639
117	NC_017545	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	386045639
118	NC_017545	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045639
119	NC_017545	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	386045639
120	NC_017545	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045639
121	NC_017545	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045639
122	NC_017545	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	386045639
123	NC_017545	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	386045639
124	NC_017545	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045639
125	NC_017545	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045639
126	NC_017545	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045639
127	NC_017545	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045639
128	NC_017545	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045639
129	NC_017545	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045639
130	NC_017545	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045639
131	NC_017545	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045639
132	NC_017545	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	386045639
133	NC_017545	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017545	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017545	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017545	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045640
137	NC_017545	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045640
138	NC_017545	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
139	NC_017545	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386045640
140	NC_017545	A	6	6	6310	6315	100 %	0 %	0 %	0 %	386045640
141	NC_017545	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386045640
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145	NC_017545	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
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148	NC_017545	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386045640
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150	NC_017545	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	386045640
151	NC_017545	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386045640
152	NC_017545	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	386045640
153	NC_017545	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
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159	NC_017545	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045640
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170	NC_017545	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045640
171	NC_017545	ATTA	2	8	7538	7545	50 %	50 %	0 %	0 %	386045640
172	NC_017545	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045640
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177	NC_017545	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045640
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180	NC_017545	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_017545	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017545	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045641
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246	NC_017545	A	6	6	10723	10728	100 %	0 %	0 %	0 %	386045642
247	NC_017545	AGT	2	6	10760	10765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045642
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249	NC_017545	AGC	2	6	10799	10804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045642
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251	NC_017545	TTA	2	6	10849	10854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045642
252	NC_017545	ACT	2	6	10865	10870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045642
253	NC_017545	TTATTT	2	12	10918	10929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386045642
254	NC_017545	A	6	6	11011	11016	100 %	0 %	0 %	0 %	386045642
255	NC_017545	ATTA	2	8	11021	11028	50 %	50 %	0 %	0 %	386045642
256	NC_017545	ACA	2	6	11050	11055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386045642
257	NC_017545	CACATT	2	12	11199	11210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386045642
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259	NC_017545	GTG	2	6	11445	11450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045642
260	NC_017545	GAA	2	6	11493	11498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386045642
261	NC_017545	AC	3	6	11538	11543	50 %	0 %	0 %	50 %	386045642
262	NC_017545	TCCT	2	8	11583	11590	0 %	50 %	0 %	50 %	386045642
263	NC_017545	TTA	2	6	11638	11643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386045642
264	NC_017545	TGA	2	6	11687	11692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045642
265	NC_017545	CGG	2	6	11711	11716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386045642
266	NC_017545	TTGAT	2	10	11755	11764	20 %	60 %	20 %	0 %	386045642
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268	NC_017545	GTG	2	6	11854	11859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386045642
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399	NC_017545	GAT	3	9	18378	18386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386045648
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401	NC_017545	TGT	2	6	18495	18500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386045648
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403	NC_017545	CTT	2	6	18564	18569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386045648
404	NC_017545	A	6	6	18671	18676	100 %	0 %	0 %	0 %	386045648
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442	NC_017545	GCA	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386045650
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500	NC_017545	AAGC	2	8	22679	22686	50 %	0 %	25 %	25 %	386045652

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